應用直接影響著物料發酵的周期及腐熟程度。 經過腐熟的物料基本實現了產品的無害化, 從而也有利于后處理過程中所加入功能菌的存活。 在發酵物料的后處理方面, 大多數企業加入功能菌劑進行復配、定形, 產品劑型以粉劑為主。 此外, 有 1/3 的產品在后處理過程中采用了造粒技術, 多數以圓盤造粒為主, 但也有采用滾筒造粒或擠壓造粒的。顆粒產品克服了粉劑產品外觀差、層次低的缺點, 提高了產品的商品性, 但同時也提高了企業的生產成本, 并對有效菌的存活產生了一定的影響。