畜禽糞尿是畜產廢棄物中數量最多、危害最嚴重的污染源。畜禽每天排出的糞尿量相當于體重的5%-8%。據測定：一個10萬只雞場，年產雞糞可達3600t，雞糞中BOD5總量為人糞尿的0.7倍；一個5000頭的豬場每天排出的糞尿約10t，一頭豬的排泄量相當于2個人的排泄量，豬糞尿中BOD5總量為人糞尿的13倍。畜禽糞尿不僅數量大，其所含的污染物數量和種類也非常多，主要包括：糞尿本身及其分解物所含的惡臭成分，糞尿厭氧條件下分解產生的大量硫化氫、氨、醇類、酚類、酰胺類、胺類和吲哚等有機物，大量的病原菌和微生物以及重金屬和獸藥等。這些物質可通過大氣、水體和土壤污染環境，產生惡臭，刺激人畜呼吸道，引起呼吸道疾病及導致畜禽生產力下降；招引蚊蠅，孳生和傳播疾病；污染飲用水、土壤和農作物，傳播人畜共患病及畜禽傳染病。